台北捷運藍線頂埔站於2008年11月動工,2015年完工,並在同年7月6日正式啟用。出口一共有4個,1號出口位於派出所旁,與新北市警察局土城分局頂埔派出所共構;2號出口位於永福岩清水祖師廟旁,造型以海山礦坑為發想,為礦坑出口的意象;3號出口位於頂埔高科技園區前,是主要出口;4號出口位於地區大樓前,和三號出口同樣設有無障礙電梯。
頂埔站的穿堂層中,隱藏著許多有特色的地方,首先就是土城地區知名的桐花,結合頂埔地區附近科技園區的科技感,融入到頂埔站的裝飾藝術中,成為桐花的LED光牆。在穿堂層抬頭一看,還可以看到頂埔站的「穿堂之眼」,它可以引導地面光線到穿堂層,白天充份運用自然光,加上流線造型天花,非常特別。